La Secretaría Académica de la Universidad Autónoma del Estado de Morelos es responsable de asegurar la calidad e innovación de la oferta educativa en los niveles medio superior, superior y posgrado, vinculando la docencia con la generación y aplicación innovadora del conocimiento. Su quehacer se orienta a consolidar una formación que promueva en el estudiantado la capacidad de aprender a aprender y le permita un desempeño profesional de alto nivel, con una sólida conciencia ética y social.